Current open positions

PhD candidate (m/f/d) in the field of Medical Bioinformatics

We are currently seeking a PhD candidate (m/f/d)

  • Duration: initially limited to three years with the option of extension,
  • Part-time (65%)
  • Compensation according to TV-L

About us:

Our institute is a leader in the bioinformatic analysis of genetic high-throughput data, particularly in the development of biomarker signatures and advanced approaches of machine learning for personalized and systems medicine. Within the DFG-funded Clinical Research Unit KFO 5002, focused on pancreatic cancer, and the Collaborative Research Center Transregio 274, centered on the regeneration of the central nervous system, we pioneer the development of innovative computer-assisted methods in bioinformatics and artificial intelligence. This includes the analysis and integration of various OMICs data, including genomics, transcriptomics, and spatial transcriptomics.

PhD Topics:

Within these research groups, we offer ambitious young scientists the opportunity to work at the forefront of research in Medical Bioinformatics. Possible topics for doctoral theses are deeply rooted in the analysis of complex datasets and the development of methods essential for progress in the treatment of pancreatic cancer and neurological regeneration

Your Tasks:

• Support in the analysis of genomic data.

• Application and further development of methods of artificial intelligence and machine learning.

Your Profile:

• Degree (Diploma/M.Sc.) in Biology, Computer Science, Bioinformatics, Data Science, or a related field.

• Basic understanding of biological and biomedical concepts.

• Expertise in computer science, data science, and machine learning.

• Proficient in programming languages such as Python, Java, R, or JavaScript.

• Enthusiasm for working with complex data models.

• Interest in interdisciplinary collaboration.

• Excellent English language skills in both written and spoken; knowledge of German is advantageous.

• High motivation, teamwork, and initiative.

Our Offer:

• Structured and guided onboarding.

• Diverse activities in a multidisciplinary, interdisciplinary team.

• Support for internal and external training as well as scientific events.

• Participation in structured PhD programs in Biology, Molecular Medicine, Computer Science, or Data Science.

Application:

Please submit your application by 16.06. 2024. 

Please submit your application documents via the official portal: https://umg.recruiting-portal.com/r/z124gyhtcdq2rjp/PhD+candidate+fmd+in+the+field+of+Medical+Bioinformatics/37077/G%C3%B6ttingen

Das Comprehensive Cancer Center (G-CCC) der Universitätsmedizin Göttingen (UMG) sucht zum nächstmöglichen Zeitpunkt eine/n Informatiker/in (w/m/d)

  • Befristung: zunächst befristet
  • Arbeitszeit: Vollzeit
  • Entgelt: Entgelt nach TV-L
  • Anzeige veröffentlicht am 24.05.2024
  • Stelle frühestmöglich

Das UniversitätsKrebszentrum (G-CCC) ist ein interdisziplinäres Zentrum, unter dessen Dach alle onkologisch tätigen Kliniken und Institute der UMG vereint sind. Zusammen mit der Medizinischen Hochschule Hannover (MHH) fungieren wir als Comprehensive Cancer Center Niedersachsen (CCC-N) als eines der 15 Onkologischen Spitzenzentren, die von der Deutschen Krebshilfe gefördert werden. Das CCC-N arbeitet im Deutschen Netzwerk Personalisierte Medizin (DNPM) mit.

Ihre Aufgaben:

  • Erstellung und Pflege von Workflows zum Datenaustausch zwischen Kliniksystemen
  • Datenbankabfragen zur Datenauswertung und -export
  • Etablierung von Prozessworkflows in Kooperation mit den Fachabteilungen
  • Implementation von Plugins, Skripten oder Tools zur Datenverarbeitung
  • Betreuung der im G-CCC betriebenen Anwendungen und Unterstützung der Anwender bei Datenauswertungen
  • fachübergreifende Zusammenarbeit mit der Medizininformatik, der Bioinformatik, dem zentralen Rechenzentrum sowie anderen Instituten und Kliniken der UMG
  • Mitarbeit in Versorgungsforschungsprojekten, Entwicklung von Methoden zum datenschutzkonformen Datenaustausch mit Projektpartnern bzw. Implementation der im Verbund entwickelten Methoden an der UMG
  • Zusammenarbeit mit dem Medizinischen Datenintegrationszentrum (MeDIC) der UMG zum Datenaustausch und Pseudonymisierung
  • Unterstützung bei der Migration von translationalen Forschungsprojekten in die Routineversorgung
  • Erstellung und Pflege von Anforderungsanalysen und Dokumentationen

Ihr Profil:

  • Masterabschluss in Medizininformatik, Bioinformatik, Informatik oder vergleichbare Qualifikation
  • gute Kenntnisse verschiedener Programmiersprachen, insbesondere Java und Python
  • Erfahrungen mit verschiedenen Datenbankmanagmentsystemen (DBMS) (z. B. MySQL)
  • Erfahrung in der Zusammenarbeit mit Fachabteilungen
  • rasche Auffassungsgabe von fachfremden Themen
  • sehr gutes Organisationsvermögen
  • sehr gute Deutschkenntnisse in Wort und Schrift; gute Englischkenntnisse sind von Vorteil
  • arbeiten mit komplexen Datenstrukturen
  • von Vorteil: Erfahrung mit der Arbeit mit klinischen System (idealerweise Onkostar, aber auch andere Systeme).
  • von Vorteil: Erfahrung mit medizinischen Datenaustauschformaten.

Unser Angebot:

  • Entwicklungsmöglichkeiten in einem sehr interessanten Umfeld der Medizinischen Informatik
  • eine anspruchsvolle und vielseitige Tätigkeit im interdisziplinären Umfeld
  • gute Arbeitsbedingungen in einem engagierten und motivierten Team
  • ein betriebliches Gesundheitsmanagement
  • ein umfangreiches Fort- und Weiterbildungsangebot

Wir freun uns auf Ihre Bewerbung über das offizielle Portal unter dem Link:https://umg.recruiting-portal.com/r/z02og9bbpdn0kka/Informatiker+wmd/37075/G%C3%B6ttingen

Thesis offers

In our department five working groups with different focuses are working in the field of knowledge management, data analysis
generegulation, image processing and medical data science.  
We offer places both for students of biological or medical degree programmes, as well as from computer science and chemistry.

In which areas you can successfully work, depends on motivation, previous knowledge and the planned duration of your work.
 

PhD and Dr.rer. nat.
We are currently not actively recruting, but initiative applications from highly motivated students or postdocs are welcome. Please send your application including a letter of motivation, CV, and certificates to Ms. Daniela Großmann.

Medical doctoral thesis
Depending on you background and interest we always try to find a topic within the framework of our research and projects for a medical doctoral thesis. If you are intersted in performing your thesis in our department, please contact our project manager Ms. Daniela Großmann. 
 

Student assistant, practical course, Bachelor and Master theses 

Depending on your field of study, please read our prerequisites/recommendations on our teaching page in advance. Within the scope of our projects, topics for final thesis (Bachelor, Master, PhD) in the Department of Medical Bioinformatics can always occur or if you as student are interested to work in the bioinformatic field (student assistant) please contact Daniela Großmann with some information about your background and motivation.

Also check out the topics and offers of our subgroups under Research and under Projects

two people shake hands

Contact

Project Manager

Dr. Daniela Großmann

Dr. Daniela Großmann

contact information

That might also interest you

Follow us